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紀元前 2000
自古以來便從繩文時代的遺跡中出土，作為山岳修驗者常備藥而備受珍視的黃檗（黃柏）。以這種黃柏萃取物為主成分，並隨著御嶽信仰在木曾地區扎根的便是「百草」。
百草的由來眾說紛紜，其一源自中國古代醫藥的帝王神農氏「遍嚐百草（百種草藥）以試其藥效」的典故。
又一說是木曾御嶽山麓自古即有藥草自生，過去調配了各式各樣的藥草，因而以「眾多藥草」之意命名為百草。
此外，亦有蘊含著「具有相當於百種藥草功效之靈藥」之意等諸多說法。
自古以來便從繩文時代的遺跡中出土「黃檗」，據說是已確認被使用的最古老生藥。
690 關於「百草」的起源雖眾說紛紜，但據說是於7世紀（690年左右），由修驗道的開山祖師役小角（役行者）以黃柏萃取物之藥救濟民眾，並在修驗者之間代代相傳承襲下來的。
1849 百草的製作方法廣為流傳至木曾地區，是在1849年（嘉永2年）左右。相傳將御嶽信仰推廣至全國的普寬行者曾說道，
「採集御嶽山的百種靈草，細心煎煮熬製成藥，其靈驗如神，
製此藥以救眾人」
修驗者們便依此將製作方法傳授給村民。
「百草」是現今御嶽百草的原型。為煉藥，過去攤延於竹皮之上隨身攜帶。
御嶽山是橫跨長野縣木曾郡與岐阜縣下呂市縣境、標高3,067公尺的獨立峰。自古即以信仰的靈山而聞名，現今仍有眾多登山者登拜。
這座御嶽山之所以作為修驗道的道場而廣為全國所知，乃是天明年間（1780年）出現的覺明行者與普寬行者熱心傳教活動的成果。
透過兩位行者的努力，御嶽信仰的講社（由信仰同一神佛的人們所組成的團體）得以在各地確立。其後又陸續出現有力的行者，藉由此信仰可解除病苦之說廣為流傳，御嶽講社遂在全國各地相繼結成。
起初各家以各自的配方製作的百草，後來製作者們聚集起來組成組合（公會），開始共同採購原料、設置共同加工廠，逐漸組織化。在此情況下製作的百草，其包裝則由各販售者（各家）使用各自原創的設計，因此市面上販售著設計豐富多樣的產品。
1938
為了將板狀的「百草」製成更易於服用的劑型而反覆嘗試，成功開發出丸劑。
如今廣受喜愛的御岳百草丸就此誕生。
至今仍存在的苦味百草
過去百草是以大釜熬煮黃檗，將其萃取物（黃柏萃取物）熬製濃縮後以竹皮包裹販售；現今則在遵守當前醫藥品製造基準的同時，基本上仍與昔日相同，將黃檗熬煮後固化成形，作為御嶽百草販售。
從前是用鐵鎚將板狀的百草敲碎服用，如今則成形為方形，使每次服用量保持一定，恰如板狀巧克力般可沿著切痕分開服用。
在本公司廠區的腹地內，供奉著承接御嶽神社分靈的長野縣製藥株式会社內御嶽大神。
其祭神為大己貴命（おおなむちのみこと）、少彥名命（すくなひこのみこと）、國常立尊（くにとこたちのみこと）三柱。少彥名命亦是以藥祖神而聞名的神祇。
此外，其旁邊還遷建了原本位於御嶽神社舊參道的「百草元祖之碑」，碑上記載著「嘉永二年（1849年），胡桃澤彌七與小谷文七共同依循普寬行者的遺法（自過去傳承至現代的方法）謀劃，自此開始製作“百草”」。
遍布全國的黃柏製劑
在御嶽山的山麓、木曾地方作為百草流傳的「黃柏萃取物之藥」，而在傳說由役行者（役小角）所開創的奈良縣大峰山、吉野山則有「陀羅尼助」，在過去盛行踏鞴製鐵的鳥取縣則有名為「煉熊」的藥。
由於這些都是將黃檗熬煮後固化而成的製劑，或許可稱之為如兄弟般的藥。
長野縣製藥株式会社內御嶽大神
關於百草與長野縣製藥，
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讓我們以年表回顧這段悠長的歷史吧